Penapisan Virtual Senyawa–Senyawa dalam Famili Zingiberaeae sebagai Antiinflamasi Menggunakan Protokol EE_COX2_V.1.0

Esti Mulatsari (1), Esti Mumpuni (2), Feriza Sandayu (3)
(1) Fakultas Farmasi, Universitas Pancasila, Jakarta12640, Indonesia, Indonesia,
(2) Fakultas Farmasi, Universitas Pancasila, Jakarta12640, Indonesia, Indonesia,
(3) Fakultas Farmasi, Universitas Pancasila, Jakarta12640, Indonesia, Indonesia

Abstract

Berbagai penelitian tentang sifat-sifat anti-inflamasi dan anti-kanker dari berbagai senyawa dalam tanaman familia Zingiberaceae telah dilakukan baik secara in vivo maupun in vitro. Enzim yang diinduksi dan diekspresikan pada sel-sel inflamasi dan kanker dianggap sebagai target obat yang ideal untuk menghambat peradangan dan tumorgenesis, salah satunya adalah enzim siklooksigenase-2 (COX-2). Dalam penelitian ini telah dilakukan penapisan virtual senyawa dalam tanaman Kaemferia galanga, Curcuma domestica Val., Zingiber officinale dan Curcuma xanthorrhiza. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui aktivitas senyawa-senyawa tersebut sebagai penghambat enzim COX-2 secara in-silico. Penelitian ini menggunakan EE_COX2_V.1.0, protokol Structure Based Virtual Screening (SBVS) yang telah divalidasi oleh Mumpuni et al. 2014. Protokol EE_COX2_V.1.0 menggunakan berbagai aplikasi terintegrasi seperti SPORES, PLANTS, BkChem, OpenBabel dan PyMOL. Elusidasi moda ikatan dilakukan terhadap senyawa representatif aktif dan tidak aktif untuk melihat interaksi asam amino dalam binding site senyawa. Berdasarkan skor ChemPLP sebagai hasil dari simulasi docking yang dilakukan pada 27 senyawa, ada 3 senyawa yang berpotensi aktif dalam menghambat COX-2, senyawa tersebut antara lain 2-butil-3- (4-metoksifenil) -2- asam propenoat dengan 6 residu asam amino aktif, 6-shogaol dengan 10 residu asam amino aktif dan desmetoksikurkumin dengan 4 residu asam amino yang aktif.

Full text article

Generated from XML file

References

Cahyono B, Huda MDK, Limantara L. 2011. Pengaruh Proses Pengeringan Rimpang Temulawak (Curcuma xanthorriza Roxb) Terhadap Kandungan dan Komposisi Kurkuminoid. Reaktor. 13(3):165-169

Eko T. 2012. Penggunaan Coxib Dalam Tata Laksana Nyeri Nosiseptif. Denpasar. Medicina. 43(1):23-30.

Hasanah AN, Nazaruddin F, Febrina E, Zuhrotun A. 2011. Analisis Kandungan Minyak Atsiri dan Uji Aktivitas Antiinflamasi Ekstrak Rimpang Kencur (Kaempferia galanga L.). Jurnal Matematika & Sains. 16(3):147-152.

Hernani, Winarti C. 2008 (tidak diterbitkan). Kandungan Bahan Aktif Jahe dan Pemanfaatannya Dalam Bidang Kesehatan.. Bogor (ID): Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Pascapanen Pertanian. hlm 125-142.

Huang N, Shoichet BK, Irwin JJ. 2006. Benchmarking Sets for Molecular Docking. Journal of Medicinal Chemistry. 49:6789-6801.

Meiyanto E. 2011. Harapan dan Tantangan Pengembangan Agen Kemoprevensi Kanker Tepat Sasaran. [Pidato Pengukuhan Jabatan Guru Besar]. Yogyakarta (ID) : Fakultas Farmasi Universitas Gadjah Mada.

Mumpuni E, Nurrochmad A, Pranowo HD, Jenie UA dan Istyastono EP. 2014. Construction and validation of the structure based virtual screening protocols with PDB code of 3LN1 to discover cyclooxygenase-2 inhibitors. Di dalam The First International Conference on Pharmaceutics and Pharmaceuticals Science (ICPPS), 24-16 Desember 2015. Surabaya (ID): Fakultas Farmasi, Universitas Airlangga. hlm 99 – 101.

Muniroh L, Martini S, Nindya TS, Solfaine R. 2010. Minyak Atsiri Kunyit Sebagai Anti Radang Pada Penderita Gout Artritis Dengan Diet Tinggi Purin. Makara Kesehatan. 14(2):57-64.

Navya A, Jayasimha RD, Devi UM. 2011. Docking Studies on Xanthones of Mangosteen as COX-2 Inhibitors. International Journal of Applied Biology and Pharmaceutical Technology. 2(3):264-267.

[NCI] National Cancer Institute (US). Surveillance, Epidemiology and End Result (SEER). 2010. diperoleh dari: http://www.seer.cancer.gov/search?q=cytotoxic+test. Diakses pada 18 November 2013.

Yuniarti N, Ikawati Z, Istyastono EP. 2011. The Importance of ARG513 as a Hydrogen Bond Anchor to Discover COX-2 Inhibitors in a Virtual Screening Campaign. Bioinformation. 6(4):164-166.

Authors

Esti Mulatsari
estimulatsari@gmail.com (Primary Contact)
Esti Mumpuni
Feriza Sandayu
Mulatsari, E., Mumpuni, E., & Sandayu, F. (2017). Penapisan Virtual Senyawa–Senyawa dalam Famili Zingiberaeae sebagai Antiinflamasi Menggunakan Protokol EE_COX2_V.1.0. Jurnal Jamu Indonesia, 2(2), 60–67. https://doi.org/10.29244/jji.v2i2.33

Article Details

No Related Submission Found